Tårnets imponerende spir (østslesvisk præget) er tækket med egetræsspåner.

Kalkmalerierne fra ca. 1510 til 1525 - bl.a. Jesu lidelseshistorie og Johannes Døberens liv - er afdækket 1915-22 og sidst restaureret i 1956 af Egmont Lind.

Fornem trefløjet altertavle fra tiden kort før Reformationen, udført af den berømte træskærermester Claus Berg (også mester for altertavlen i Odense Domkirke). Korbuekrucifiks fra senmiddelalderen. Prædikestol i renæssancestil (1612).

Orglet er fra 1941, bygget af Marcussen og Søn, Aabenraa. Det har 14 stemmer med i alt 1026 piber.

Glasmosaik i våbenhus af Sven Havsteen-Mikkelsen, skænket til kirken af ham. Ved den nordlige indgang til kirkegården ses stadig en kreaturrist.

Alle Ærøs kirker (undtagen Ommel) er åbne hele året kl. 8.00-16.00, bortset fra, når der finder kirkelige handlinger sted. Hver dag i skolesommerferien (undtagen når der er kirkelige handlinger) er der en kirkevært til stede kl. 11.00 - 15.00 med tilbud om gratis rundvisning i kirken.