Søby Kirke er fra 1745. Indtil da søgte man Bregninge kirke.

Professor Jørgen Roed har i 1870 malet alterbilledet, der viser Kristus på korset og jomfru Maria knælende derved. Pietàmaleriet (jomfru Maria med Jesu døde legeme) er malet af Magdalene Hammerich i 1917 og skænket af hendes broder billedhuggeren Gunnar Hammerich i forbindelse med kirkens hovedrestaurering i 1978.

I kirkens enkle indre minder det himmelblå bræddeloft og de korngule bænke om det frodige omliggende landskab.

Orgel, 10 stemmer, Frobenius, 1984.

Alle Ærøs kirker (undtagen Ommel) er åbne hele året kl. 8.00-16.00, bortset fra, når der finder kirkelige handlinger sted.